Како је Филолошко уметнички факултет настао 2002. године као симбиоза три одсека: Одсека за музичку уметност, Одсека за примењену уметност и Одсека за филологију, сваки од Одсека, а тако и Одсек за музичку уметност има своју предисторију. Изникао је из Наставног одељења Факултета музичке уметности из Београда, које је основано 1998. године, у највећој мери као последица вишегодишњих изузетних резултата крагујевачке школе хармонике, како на националном, тако и на међународном плану. У нашој земљи је, током дужег времена, била изражена потреба за покретањем студија хармонике, јер се за овај инструмент у музичким школама опредељивао највећи број ученика, а настава није била покривена одговарајућим, квалификованим кадровима. Тако су у Наставном одељењу ФМУ у Крагујевцу организоване најпре студије Хармонике, данас препознате као лидер у читавом региону, и Опште музичке педагогије, а 2000. године су уведене и студије Гудачких инструмената. Оснивање овог студијског програма настаје као израз жеље да се створи клица из које ће се развити будући професионални камерни, а касније и симфонијски оркестар, као носилац музичког живота, толико потребан Крагујевцу и читавом региону. Не треба заборавити чињеницу да је први српски оркестар стасао управо у нашем граду. Зато ову традицију треба неговати и у 21. веку.

Наставно одељење ФМУ током 2002. године прераста у Одсек за музичку уметност Филолошко- уметничког факултета Универзитета у Крагујевцу, који веома брзо постаје важан део ФИЛУМ-а и један од покретача и носилаца музичког живота у граду. Како је крагујевачка музичка школа „др Милоје Милојевић“ једна од водећих музичких школа у Србији, сасвим је природно да се, сразмерно томе, и Одсек за музичку уметност брзо ширио. Већ 2005. су покренуте нове студије Флауте, Соло певања и, посебно, Музике у медијима, јединственог програма у нашој земљи, који школује будуће уреднике музичких редакција радио и тв програма. Нешто касније, 2007. године, покренуте су студије Клавира, инструмента без којега није могуће замислити музички живот било које средине.

Од 2008. године, заједно са осталим одсецима ФИЛУМ-а, Одсек за музичку уметност укључује се у процес акредитације, који је успешно обављен акредитацијом седам студијских програма основних академских студија: Хармоника, Гудачки инструменти, Флаута, Клавир, Соло певање, Музичка педагогија и Музика у медијима. Две године касније, акредитована су и три студијска програма мастер академских студија: Хармоника, Музичка педагогија и Музика у медијима.

У другом циклусу акредитације (од 2013. године) акредитовани су програми основних и мастер студија Музичка теорија и педагогија, Музика у медијима и Извођачке уметности, са следећим модулима: хармоника, клавир, гудачки инструменти (виолина, виола, виолончело, контрабас), дувачки инструменти (флаута, обоа, кларинет, хорна и фагот), соло певање и камерна музика. Увођење студија обое, кларинета, хорне и фагота проведено је у оквиру ТЕМПУС пројекта Introducing Interdisciplinarity in Music Studies in the Western Balkans in Line with EuropeanPerspective, у коме је ФИЛУМ био један од партнера. У оквиру истог пројекта, на ФИЛУМ-у су засноване докторске студије хармонике, прве докторске уметничке студије на ФИЛУМ-у, чиме је симболично затворен један круг у историји ФИЛУМ-а, од покретања Наставног одељења ФМУ из Београда на крилима крагујевачке школе хармонике, до докторских уметничких студија хармонике, јединствених у Србији и ширем региону.

На Одсеку за музичку уметност данас је запослено преко шездесет наставника и сарадника, и на њему је ангажовано још десетак наставника и сарадника са других факултета. У досадашњем раду, Одсек је имао част да сарађује са гостујућим професорима изузетног реномеа, извођачима интернационалне каријере и професорима престижних европских високих музичких школа. Зато, само можемо закључити: за петнаест година рада, један успешни Одсек пред којим је још светлија будућност, који даје специфичан академски тон факултету и музичком образовању у нашој земљи, и специфичан културни тон граду Крагујевцу, земљи и региону.